O anime é situado na escola Shinigami técnico para usuário e arma, Soul Eater gira em torno de 3 grupos de armas e usuários que tentam fazer um último "Death Scythe" e, portanto, apto para ser utilizado pelo Shinigami, eles têm de recolher 99 almas dos seres humanos maus e 1 de bruxa.

Ao fazer isso armas e usuário se tornará um Death Scythe, que é o mais alto título de uma arma. Maka, Soul, Black Star, Tsubaki, Death the Kid, Liz e Patty Thompson são os personagens principais de Soul Eater. Além de tomar o tempo para recolher almas os estudantes de Shibusen têm que defender Death City dos mais poderosos bruxos e de outras criaturas enquanto ainda freqüentam a escola e tentam se tornar mais fortes.